Преподобні Марк, Іона і Васса вшановуються як родоначальники Псково-Печерського монастиря.
Точно невідомо, коли поселилися перші монахи-відлюдники при струмку Кам'янці в самородних печерах гори, яку місцеві жителі називали "святою горою". Монастирський літопис передає розповідь очевидців, звіроловів з Ізборських на прізвисько Селиши: "Раз випадково прийшли ми з батьком на край гори, де нині церква Богородиці, і чуємо як ніби церковний спів; співали злагоджено, благоговійно, а співаків не видно було, і повітря наповнене був пахощами ладану ".
З перших старців Псково-Печерської обителі на ім'я відомий лише один Марк. Про нього засвідчується: "На початку спершу якийсь старець жив біля потоку Кам'янця при печері, його ж декотрі ловці бачили біля трьох камнів, що лежить над церквою Пресвятої Богородиці печерної; але про це відомо не могли знати, який старець це був, і якого роду, або яким чином і звідки на це місце прийшов, і скільки часу прожив, і коли упокоївся ". Другий ігумен Печерської обителі вніс ім'я старця Марка в монастирський синодик. Преподобний ігумен Корнилій (пам'ять 20 лютого) засумнівався у вірності цього запису і велів згладити його ім'я з синодика. Раптово він тяжко захворів і отримав одкровення, що покараний за те, що наказав викреслити ім'я преподобного Марка з монастирського диптиха. Попросивши прощення слізної молитвою біля гробу старця Марка, ігумен Корнилій відновив його святе ім'я. Коли була викопана печерна церква Успіння Пресвятої Богородиці та розширені похоронні печери, ігумен Дорофей знайшов гріб преподобного Марка зотлілим, а мощі і одяг неушкодженими.
У 1472 році селянин Іван Дементьєв рубав ліс на обриві гори. Одне з зрубаних дерев покотилося вниз, здираючи землю і вириваючи з коренем інші дерева. Обвал відкрив вхід до печери, над якою був напис: "Богом збудована печера". (Є передання про те, що якийсь юродивий монах Варлаам часто приходив до печери і стирав цей напис, але вона всякий раз чудово відновлювалася.)
На це святе місце, намолене першими подвижниками, прийшов священик Іоанн на прізвисько "Шестнік" - переселенець. Він був родом з "Московської країни" і священнодіяв у Юр'єві (нині Тарту) в "правовірній церкві, поставленої псковичами" в ім'я святителя Миколая і великомученика Георгія, разом зі священиком Ісидором духовно оформляли русських людей, які жили там. У 1470 році батько Іоанн був змушений тікати з родиною в Псков від переслідувань німців-католиків. Дізнавшись про мученицьку кончину свого товариша (пам'ять священномученика Ісидора 8 січня), Іоанн вирішив піти в новоявлену "Богом збудовану печеру", щоб там, на самому кордоні з Лівонією, заснувати монастир як твердиню Православ'я.
Незабаром захворіла його дружина і, прийнявши чернечий постриг з ім'ям Васса, померла. Праведність її була засвідчена відразу ж після смерті. Її чоловік і духовний батько поховали преподобну Вассу в стіні "Богом збудованої печери", але вночі її гріб був "вийнятий із землі невидимою Божою силою". Отець Іоанн і духівник преподобної Васси зніяковіли, вирішивши, що це сталося тому, що вони не повністю здійснили чин відспівування, вдруге відспівали її і знову поховали тіло, але на ранок воно знову опинилося "на верху землі". Тоді стало ясно, що це - знамення Боже. Гріб преподобної Васси поставили в печері з лівого боку. Вражений дивом Іоанн прийняв чернецтво з ім'ям Іони і став подвизатися ще старанніше.
Власноруч викопав печерну церкву та дві келії на стовпах, він став просити священиків Псковського Троїцького собору освятити її, але ті зважилися не відразу, "заради незвичайного місця". Тоді преподобний Іона попросив благословення у Новгородського архієпископа Феофіла.
15 серпня 1473 печерний храм був освячений на честь Успіння Пресвятої Богородиці. При освяченні сталося диво від ікони Успіння Пресвятої Богородиці - прозріла сліпа жінка - "послав Милосердний Бог початок Своїх великих дарів Пречистою Своєю Матір'ю". (Ця ікона, яку називають "старою" на відміну від іншої чудотворної ікони Успіння Пресвятої Богородиці з житієм Її, написаної близько 1521 псковським іконописцем Олексієм Малим, зберігається зараз у вівтарі Успенського храму на горньому місці. Ікона з житієм - храмова ікона печерної церкви. ) День освячення печерного храму вважається офіційною датою заснування Псково-Печерського монастиря. Преподобний Іона подвизався в печерній обителі до 1480 року і мирно відійшов до Господа. Після смерті на його тілі виявили кільчастий панцир, який був повішений над його гробом як свідок даних подвигів преподобного, але при набігу німців він був викрадений.
Мощі преподобного Іони спочивають в печерах поряд з мощами преподобного старця Марка й преподобної Васси. Одного разу при нападі на монастир Ливонський лицар, насміхаючись над святими мощами, хотів мечем відкрити кришку гробу преподобної Васси, але його обпалило що вийшли з гробу святої подвижниці полум'я. Сліди цього караючого вогню до цих пір видно на гробі преподобної Васси.
