После политической смерти средневековой Сербии войско, а также сотни тысяч сербов бежали в Венгрию. Поэтому в начале 16 в. почти половину населения Венгрии составляли сербы. Обезлюдела центральная часть долины р. Моравы, освоенная сербами еще в 12–14 вв. Многие сербы ушли в леса, другие бежали во владения Габсбургов, где стали солдатами-колонистами в пограничных районах, созданных для отражения натиска турок.
В 1557 султан Сулейман Великолепный (правил в 1520–1566) разрешил возродить Печский патриархат, прекративший существование в 1459. Причиной этого акта стало желание Мехмеда Соколовича, османского визиря сербского происхождения (из Боснии), показать свою принадлежность и к сербскому народу, и к османскому государству, и к православной церкви, и к мусульманской вере. На его решение повлияло также намерение получить поддержку со стороны церкви, добивавшейся восстановления патриархата. Однако Сербская церковь, защитник идеи централизованного государства в средневековую эпоху, выступила теперь в роли хранителя национальной идеи. Во время войны 1593–1606 Османской империи с Австрией Сербская церковь руководила рядом восстаний южных славян против османского владычества.
В период австро-турецкой войны 1683–1699 Джордже Бранкович (1645–1711), потомок семьи Бранковичей, правившей в 15 в. сербским вассальным государством, пытался добиться поддержки со стороны России и Австрии в создании Иллирийского (славянского) королевства на пространстве от Адриатики до Черного моря. По «государственным соображениям» австрийское правительство интернировало Бранковича и держало его в плену в течение двух десятилетий. Народ Сербии и Македонии восстал против турок и оказал помощь войскам Габсбургов, оккупировавшим Скопье. Церковь стала на сторону народа и руководила им. Когда немецкие и австрийские армии были вынуждены покинуть Македонию и Сербию, патриарх Печский бежал вместе с многими тысячами сербских и македонских семей, которые поселились в южной части Венгрии (Воеводине), освобожденной от османского ига.
После 1690 фанариотам (богатым грекам, которые покупали церковные и государственные должности у османского правительства) часто удавалось поставлять греческих иерархов на Печскую кафедру. В 1767 султан Мустафа III по настойчивой просьбе фанариотов и патриарха Константинопольского упразднил Печский патриархат, а в 1768 – архиепископство Охридское.
В 1766–1830 в Сербии верховными иерархами церкви были в основном греки, народ воспринимал их как чужеземцев. Созданная в начале 18 в. сербская православная митрополия в Сремски-Карловци (в Славонии) взяла на себя духовное руководство сербским народом, но ее власть не распространялась на территории, находящиеся под управлением Османской империи. В османской Сербии, или Белградском пашалыке, церковь перестала играть роль национального объединяющего фактора. Власть перешла в руки местных князей, гайдуков (разбойников), торговцев и солдат-добровольцев, которые во время русско-турецкой войны 1787–1791 сражались вместе с австрийцами против турок. В этой войне несколько тысяч сербов получили военный опыт и тактические знания, и по окончании войны добились от султана признания своей автономии. Османское правительство и его представитель в пашалыке (паша – губернатор Белграда) позволили сербам использовать оружие против армии мятежного губернатора Видина (Верхней Болгарии) Пазвандоглу.
Однако оккупация Наполеоном Египта (1798) вынудила Турцию в целях самообороны пересмотреть свою политику в отношении Пазвандоглу и его янычар (османской пехоты). Янычары и другие солдаты-наемники, воспользовавшись создавшимся положением, перешли границу Сербии, убили белградского пашу, установили собственную власть, лишили сербов имущества, потребовали платить незаконную ренту и оскверняли сербские жилища. В их планы входило уничтожение новых сербских лидеров, стремившихся восстановить сербскую государственность.
Восстания Карагеоргия Петровича и Милоша Обреновича.В 1804 сербы Шумадии решили оказать сопротивление новой тирании. Лидером национального движения стал Георгий Петрович, по прозвищу Карагеоргий (турец. «Черный Георгий») – торговец, гайдук, полководец в период австро-турецкой войны 1788–1791.
В 1805–1807 сербское восстание распространилось за пределы Белградского пашалыка в соседние населенные сербами районы Османской и Габсбургской империй. Удачные выступления российской армии против турок в ходе войны 1806–1812 способствовали и сербским военным успехам в 1807. Вслед за Тильзитским миром, заключенным в 1807 между Александром I и Наполеоном, последовало и русско-турецкое перемирие. Обратившийся к Австрии и Наполеону за военной помощью Карагеоргий получил решительный отказ.
В конце 1809 Россия возобновила военные действия против Турции, однако к тому времени сербы были расколоты. Образованные сербы из Воеводины, примкнувшие к движению национального освобождения, выступали за формирование конституционного государства. Сам Карагеоргий планировал создать сильную централизованную монархию. В 1812 был заключен мир России с Турцией, а сербские силы были разгромлены летом 1813.
Последовавший за этим террор со стороны Турции послужил причиной восстания 1815 под руководством Милоша Обреновича. По условиям Адрианопольского мирного договора, которым завершилась русско-турецкая война 1828–1829, и под угрозой возможной российской интервенции османское правительство предоставило Сербии некоторую степень автономии. Раздавая взятки турецким чиновникам в городах-крепостях, Милош еще более укрепил свое влияние. Кроме того, он расправился со своими основными соперниками и личными врагами, в том числе Карагеоргием.
В 1830 турецкий султан подтвердил автономный статус Сербии и признал Милоша наследственным сербским правителем – князем в Белградском пашалыке. В 1833 Стамбул официально признал упразднение феодального права в обмен на согласие Сербии платить фиксированную и регулярную дань; ей было разрешено занять некоторые территории, являвшиеся ранее предметом тяжбы с турками. Тем не менее в Белграде и ряде других городов-крепостей турецкие гарнизоны сохранялись вплоть до 1867. Европейские державы на Берлинском конгрессе 1878 признали Сербию независимым государством.
